{"id":83,"date":"2004-03-31T12:40:15","date_gmt":"2004-03-31T03:40:15","guid":{"rendered":"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/?p=83"},"modified":"2018-12-10T12:56:59","modified_gmt":"2018-12-10T03:56:59","slug":"sarnews-no-6","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/en\/sarnews-no-6\/","title":{"rendered":"SARNews No.6"},"content":{"rendered":"<p><ahref=\"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/wp-content\/uploads\/2018\/09\/SARNews_6.pdf\">SARNews_6<\/a><\/p>\n<p>\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u90e8\u4f1a\u30fb\u30cb\u30e5\u30fc\u30b9\u30ec\u30bf\u30fc&lt;31March2004&gt;SARNewsNo.6\u300c\u76ee\u6b21\u300d\uff3b\u8a18\u4e8b\uff3d\/\/\/QSAR\u4eca\u6614\/\/\/\u79c1\u3068QSAR.\u508d\u89b3\u304b\u3089\u5b9f\u8df5\u3078\u306e\u9053\u7a0b.\u897f\u6751\u52c1\u4e00\u90ce\uff65\uff65\uff65\uff12\/\/\/\u7814\u7a76\u7d39\u4ecb\/\/\/\u80fd\u52d5\u5b66\u7fd2\u6cd5\u3092\u5229\u7528\u3057\u305f\u30da\u30d7\u30c1\u30c9\u30ef\u30af\u30c1\u30f3\u958b\u767a\u6a5f\u68b0\u5b66\u7fd2\u306b\u3088\u308b\u85ac\u7269\u5316\u5b66\u69cb\u9020\u304b\u3089\u306e\u6d3b\u6027\u30af\u30e9\u30b9\u8b58\u5225\u5bae\u5ddd\u77e5\u4e5f\u9ad8\u6a4b\u7531\u96c5\u9326\u7e54\u514b\u5df1\u85e4\u5cf6\u609f\u5fd7\uff65\uff65\uff65\uff15\uff65\uff65\uff65\uff11\uff10\uff3b\u5831\u544a\uff3d\u30fb\u7b2c31\u56de\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u9ad8\u6a4b\u5178\u5b50\u30fb\u7b2c31\u56de\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u30fb\u30dd\u30b9\u30bf\u30fc\u8cde\u306e\u7814\u7a76\u7d39\u4ecbKP14\u5206\u5b50\u91cd\u306d\u5408\u308f\u305b\u306b\u57fa\u3065\u304f\u6d3b\u6027\u5316\u5408\u7269\u89e3\u6790\u30b7\u30b9\u30c6\u30e0\u306e\u958b\u767a\u91ce\u4e2d\u306f\u308b\u307f\uff0c\u5bcc\u5ca1\u4f38\u592b\uff0c\u677f\u4e95\u662d\u5b50KP19\u6a19\u7684\u86cb\u767d\u8cea\u306eInducedFit\u3092\u8003\u616e\u3057\u305f\u30ea\u30ac\u30f3\u30c9\u30c9\u30c3\u30ad\u30f3\u30b0(1)\uff1a\u30d6\u30e9\u30a6\u30f3\u52d5\u529b\u5b66\u6cd5\u3092\u7528\u3044\u305f\u8907\u5408\u4f53\u69cb\u9020\u6700\u9069\u5316\u5c71\u4e59\u6559\u4e4b\uff0c\u5e83\u91ce\u4fee\u4e00KP28SOM\u30d5\u30a3\u30eb\u30bf\u30fc\u3092\u7528\u3044\u305fQSAR\u30e2\u30c7\u30ea\u30f3\u30b0\u79cb\u5143\u7d17\u6075\uff0c\u4f50\u3005\u6728\u82f1\u53f2\uff0c\u9ad8\u6a4b\u7531\u96c5\uff65\uff65\uff65\uff11\uff14\uff65\uff65\uff65\uff11\uff15\uff65\uff65\uff65\uff11\uff18\uff65\uff65\uff65\uff12\uff11\uff3b\u304a\u77e5\u3089\u305b\uff3d\u30fb\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30d5\u30a9\u30fc\u30e9\u30e02004\u30fb\u7b2c32\u56de\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\uff65\uff65\uff65\uff12\uff12\uff65\uff65\uff65\uff12\uff13\/\/\/\/\/QSAR\u4eca\u6614\/\/\/\/\/\u79c1\u3068QSAR.\u508d\u89b3\u304b\u3089\u5b9f\u8df5\u3078\u306e\u9053\u7a0b.\u5927\u962a\u5e9c\u7acb\u5927\u5b66\u5148\u7aef\u79d1\u5b66\u7814\u7a76\u6240\u57fa\u790e\u79d1\u5b66\u90e8\u9580\u897f\u6751\u52c1\u4e00\u90ce\u8fb2\u85ac\u306e\u4f5c\u7528\u6a5f\u69cb\u306e\u3053\u3068\u3082\u77e5\u3089\u305a\u3001\u300c\u8fb2\u85ac\u306e\u4f5c\u7528\u6a5f\u69cb\u306e\u5b9f\u9a13\u3092\u3057\u305f\u3044\u300d\u3068\u8a00\u3063\u3066\u4eac\u5927\u8fb2\u5b66\u90e8\u8fb2\u82b8\u5316\u5b66\u79d1\u8fb2\u85ac\u5316\u5b66\u8b1b\u5ea7\u306e\u9580\u3092\u305f\u305f\u3044\u305f\u306e\u306f\u3001\u4eca\u304b\u308940\u5e74\u8fd1\u304f\u3082\u524d\u306e\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b\u3002\u6234\u3044\u305f\u5352\u8ad6\u30c6\u30fc\u30de\u306f\u3001\u5c3f\u7d20\u7cfb\u9664\u8349\u5264\u306e\u5408\u6210\u3068Hill\u53cd\u5fdc\u963b\u5bb3\u6d3b\u6027\u306e\u6e2c\u5b9a\u3067\u3042\u3063\u305f\u3002\u5b66\u90e8\u3092\u5352\u696d\u3057\u3066\u4fee\u58eb\u8ab2\u7a0b\u306b\u5165\u308b\u3053\u3068\u306b\u306a\u3063\u3066\u30c6\u30fc\u30de\u3092\u6c7a\u3081\u308b\u3068\u304d\u3001\u307e\u3060\u61f2\u308a\u305a\u306b\u300c\u8fb2\u85ac\u306e\u4f5c\u7528\u6a5f\u69cb\u306e\u5b9f\u9a13\u3092\u3057\u305f\u3044\u300d\u3068\u8a00\u3063\u305f\u3082\u306e\u3067\u3042\u308b\u3002\u305d\u306e\u5e74\u304b\u3089\u85e4\u7530\u7a14\u592b\u5148\u751f\u304c\u540c\u8b1b\u5ea7\u306e\u52a9\u6559\u6388\u306b\u5c31\u4efb\u3055\u308c\u3001\u7b46\u8005\u306e\u30c6\u30fc\u30de\u306b\u3064\u3044\u3066\u306e\u76f8\u8ac7\u304c\u5148\u751f\u65b9\u306b\u3088\u3063\u3066\u884c\u308f\u308c\u305f\u3002\u79c1\u81ea\u8eab\u306f\u3042\u307e\u308a\u3088\u304f\u89e3\u3089\u306a\u3044\u307e\u307e\u306b\u85e4\u7530\u5148\u751f\u306e\u3054\u6307\u5c0e\u3067s-\u30c8\u30ea\u30a2\u30b8\u30f3\u985e\u306e\u5408\u6210\u304b\u3089\u59cb\u3081\u308b\u3053\u3068\u306b\u306a\u3063\u305f\u3002\u305d\u308c\u306a\u308a\u306b\u5408\u6210\u3082\u9032\u3093\u3067\u5316\u5408\u7269\u3082\u5e7e\u3064\u304b\u3067\u304d\u3066\u3044\u305f\u304c\u3001\u3069\u3046\u3082\u6e80\u8db3\u611f\u304c\u306a\u3044\u3002\u4e00\u4f53\u3053\u308c\u3063\u3066\u4f55\u306e\u305f\u3081\u306b\u3057\u3066\u3044\u308b\u3093\u3060\u308d\u3046\u3068\u3002\u85e4\u7530\u5148\u751f\u306f\u79c1\u304c\u5b9f\u9a13\u3057\u3066\u3044\u305f\u3068\u3053\u308d\u3068\u306f\u5c11\u3057\u96e2\u308c\u305f\u90e8\u5c4b\u306b\u304a\u3089\u308c\u3001\u8a2a\u308c\u3066\u805e\u304f\u306e\u3082\u6577\u5c45\u306e\u9ad8\u3044\u601d\u3044\u3092\u3057\u3066\u3044\u308b\u307e\u307e\u306b\u590f\u9803\u307e\u3067\u65e5\u306b\u3061\u304c\u904e\u304e\u53bb\u3063\u305f\u3002\u305d\u306e\u9803\u306b\u306a\u3063\u3066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a\u8ad6\u6587\u8a8c\uff082002\uff09Vol.J85-D-II,pp.717-724.2)\u9ebb\u751f\u5ddd\u307b\u304b\uff1b\u300c\u80fd\u52d5\u5b66\u7fd2\u6cd5\u3092\u5229\u7528\u3057\u305f\u5275\u85ac\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u300dNEC\u6280\u6cd5\uff082003\uff09Vol.56,No.10,33-37.3)MamitsukaH.\u201cPredictingpeptidesthatbindtoMHCmoleculesusingsupervisedlearningofhiddenMarkovmodels.\u201d(1998)Proteins,33,460-474.4)UdakaK.et.al.\u201dEmpiricalevaluationofadynamicexperimentdesignmethodforpredictionofMHCclassI-bindingpeptides.\u201d(2002)J.Immunol.,169,5744-5753.5)ParkerK.et.al.\u201cSchemeforrankingpoteintialHLA-A2bindingpeptidesbasedonindependentbindingofindividualpeptideside-chains.\u201d(1994)J.Immunol.,152,163-175.6)RammenseeH.et.al.\u201cSYFPEITHI:databaseforMHCligandsandpeptidemotifs.\u201d(1999)Immunogenitics,50,213-219.7)Udakak.et.al.\u201dAnautometedpredictionofMHCclassI-bindingpeptidesbasedonpositionalscanningwithpeptidelibraries.\u201d(2000)Immunogenetics,51,816-828.8)OkaY.et.al.\u201dWilmstumorgenepeptide-basedimmunotherapyforpatientswithovertleukemiafrommyelodysplasticsyndrome(MDS)orMDSwithmyelofibrosis.\u201d(2003)Int.J.Hematology,78,56-61.\/\/\/\/\/\u7814\u7a76\u7d39\u4ecb\/\/\/\/\/\u6a5f\u68b0\u5b66\u7fd2\u306b\u3088\u308b\u85ac\u7269\u5316\u5b66\u69cb\u9020\u304b\u3089\u306e\u6d3b\u6027\u30af\u30e9\u30b9\u8b58\u5225\u8c4a\u6a4b\u6280\u8853\u79d1\u5b66\u5927\u5b66\u30fb\u77e5\u8b58\u60c5\u5831\u5de5\u5b66\u7cfb\u9ad8\u6a4b\u7531\u96c5.\uff0c\u9326\u7e54\u514b\u5df1\uff0c\u85e4\u5cf6\u609f\u5fd71.\u306f\u3058\u3081\u306b\u73fe\u5728\uff0c\u533b\u85ac\u3084\u8fb2\u85ac\u306a\u3069\u306e\u958b\u767a\u7814\u7a76\u306e\u5834\u3067\u306f\u65e2\u5b58\u85ac\u7269\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u80cc\u666f\u306b\uff0c\u85ac\u5316\u5408\u7269\u306e\u5316\u5b66\u69cb\u9020\u3068\u751f\u7406\u6d3b\u6027\u306a\u3069\u7a2e\u3005\u306e\u4f5c\u7528\uff08\u307e\u305f\u306f\u7279\u6027\uff09\u3068\u306e\u9593\u306e\u95a2\u4fc2\u3092\u7a4d\u6975\u7684\u306b\u898b\u51fa\u3057\uff0c\u3053\u308c\u3089\u306e\u60c5\u5831\u3092\u6d3b\u7528\u3059\u308b\u3053\u3068\u306b\u3088\u3063\u3066\u65b0\u898f\u6709\u7528\u7269\u8cea\u306e\u5408\u7406\u7684\u306a\u958b\u767a\u3092\u9032\u3081\u3088\u3046\u3068\u3059\u308b\u69d8\u3005\u306a\u8a66\u307f\u304c\u884c\u308f\u308c\u3066\u3044\u308b\u3002\u307e\u305f\uff0c\u591a\u5927\u306a\u52aa\u529b\u306b\u3088\u3063\u3066\u751f\u307f\u51fa\u3055\u308c\u308b\u65b0\u85ac\u306e\u767b\u5834\u306e\u4e00\u65b9\u3067\uff0c\u4f8b\u3048\u3070\u5927\u304d\u306a\u671f\u5f85\u3092\u80cc\u8ca0\u3063\u3066\u767b\u5834\u3057\u305f\u533b\u85ac\u54c1\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u91cd\u7be4\u306a\u526f\u4f5c\u7528\u304c\u5831\u544a\u3055\u308c\u305f\u308a\uff0c\u8fb2\u85ac\u306b\u304a\u3044\u3066\u306f\u305d\u306e\u30d2\u30c8\u5065\u5eb7\u5f71\u97ff\u3084\u6b8b\u7559\u6027\u306b\u3088\u308b\u74b0\u5883\u5f71\u97ff\u306a\u3069\u304c\u793e\u4f1a\u7684\u306a\u554f\u984c\u3068\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u7b46\u8005\u3089\u306f\uff0c\u3053\u3046\u3057\u305f\u5316\u5b66\u7269\u8cea\u306e\u30ea\u30b9\u30af\u8a55\u4fa1\u306e\u554f\u984c\u306b\u95a2\u9023\u3057\uff0c\u85ac\u7269\u306e\u5316\u5b66\u69cb\u9020\u60c5\u5831\u306e\u307f\u304b\u3089\u305d\u306e\u6d3b\u6027\uff08\u6bd2\u6027\uff09\u7b49\u306e\u4f5c\u7528\u306e\u6709\u7121\u3092\u8b58\u5225\u30fb\u4e88\u6e2c\u3059\u308b\u3053\u3068\u3092\u306d\u3089\u3044\u3068\u3057\uff0c\u5316\u5b66\u69cb\u9020\u306eTFS(TopologicalFragmentSpectra)\u8868\u73fe\u306b\u3082\u3068\u3065\u304f\u69cb\u9020\u985e\u4f3c\u6027\u8a55\u4fa1\u3084\u6a5f\u68b0\u5b66\u7fd2\u3092\u57fa\u790e\u3068\u3057\u305f\u6d3b\u6027\u4e88\u6e2c\u3084\u30ea\u30b9\u30af\u63a8\u5b9a\u306e\u53ef\u80fd\u6027\u306b\u3064\u3044\u3066\u691c\u8a0e\u3092\u9032\u3081\u3066\u3044\u308b[1,2]\u3002\u672c\u7a3f\u3067\u306f\uff0c\u5206\u985e\u5b66\u7fd2\u30e2\u30c7\u30eb\u3068\u3057\u3066\u8fd1\u5e74\u6ce8\u76ee\u3092\u96c6\u3081\u3066\u3044\u308b\u30b5\u30dd\u30fc\u30c8\u30d9\u30af\u30bf\u30fc\u30de\u30b7\u30f3\uff08SupportVectorMachine\uff0c\u4ee5\u4e0bSVM\uff09\u3092\u7528\u3044\u305f\u85ac\u7269\u6d3b\u6027\u30af\u30e9\u30b9\u5206\u985e\u306b\u304a\u3051\u308b\u8a66\u307f\u306b\u3064\u3044\u3066\u7d39\u4ecb\u3059\u308b\u3002\uff12\uff0e\u30b5\u30dd\u30fc\u30c8\u30d9\u30af\u30bf\u30fc\u30de\u30b7\u30f3\uff08SVM\uff09\u8a08\u7b97\u6a5f\u51e6\u7406\u80fd\u529b\u306e\u6025\u901f\u306a\u9032\u5c55\u3068\u5927\u5bb9\u91cf\u8a18\u61b6\u5a92\u4f53\u306e\u4f4e\u5ec9\u5316\u306b\u4f34\u3044\uff0c\u81a8\u5927\u306a\u60c5\u5831\u306e\u53ce\u96c6\u304c\u5bb9\u6613\u306b\u884c\u3048\u308b\u3088\u3046\u306b\u306a\u3063\u305f\u3002\u3053\u3046\u3057\u305f\u73fe\u72b6\u3092\u80cc\u666f\u306b\uff0c\u6700\u8fd1\u3067\u306f\u69d8\u3005\u306a\u5206\u91ce\u306b\u304a\u3044\u3066\u30c7\u30fc\u30bf\u30de\u30a4\u30cb\u30f3\u30b0\u3042\u308b\u3044\u306f\u30c1\u30e3\u30f3\u30b9\u767a\u898b\u3068\u547c\u3070\u308c\u308b\uff0c\u5927\u91cf\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u6709\u7528\u306a\u77e5\u8b58\u3092\u767a\u6398\u8d85\u5e73\u9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