{"id":119,"date":"2013-04-01T12:42:58","date_gmt":"2013-04-01T03:42:58","guid":{"rendered":"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/?p=119"},"modified":"2018-12-10T12:49:10","modified_gmt":"2018-12-10T03:49:10","slug":"sarnews-no-24","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/en\/sarnews-no-24\/","title":{"rendered":"SARNews No.24"},"content":{"rendered":"<p><ahref=\"https:\/\/sar.pharm.or.jp\/wp-content\/uploads\/2018\/09\/SARNews_24.pdf\">SARNews_24<\/a><\/p>\n<p>\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u90e8\u4f1a\u30fb\u30cb\u30e5\u30fc\u30b9\u30ec\u30bf\u30fc<1April,2013>SARNewsNo.24\u300c\u76ee\u6b21\u300d\/\/\/\/\/Perspective\/Retrospective\/\/\/\/\/\u5275\u85ac\u652f\u63f4\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u3068\u30d0\u30a4\u30aa\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30de\u30c6\u30a3\u30af\u30b9\u306b\u3088\u308b\u30c7\u30fc\u30bf\u7d71\u5408\u6c34\u53e3\u8ce2\u53f8\uff65\uff65\uff65\uff12\/\/\/\/\/CuttingEdge\/\/\/\/\/PubChemBioAssay\u306e\u6d3b\u7528\u3068\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30d7\u30ed\u3068\u306e\u5354\u696d\u5c0f\u5cf6\u53f2\u7167\u3001\u5c71\u672c\u5bcc\u7f8e\u5b50\u3001\u4e2d\u6751\u898f\u5b50\u3001\u82e5\u6797\u5b8f\u660e\uff65\uff65\uff65\uff17\/\/\/\/\/SARPresentationAward\/\/\/\/\/2012\u5e74\u5ea6\u9078\u8003\u7d50\u679c\u306b\u3064\u3044\u3066\uff65\uff65\uff65\uff11\uff14\u53d7\u8cde\u30b3\u30e1\u30f3\u30c8\uff65\uff65\uff65\uff11\uff15\u53d7\u8cde\u767a\u8868\u8981\u65e8\uff65\uff65\uff65\uff11\uff16\/\/\/\/\/Activities\/\/\/\/\/\uff1c\u5831\u544a\uff1e\u7b2c9\u56de\u85ac\u7269\u306e\u5206\u5b50\u8a2d\u8a08\u3068\u958b\u767a\u306b\u95a2\u3059\u308b\u65e5\u4e2d\u5408\u540c\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u958b\u50ac\u5831\u544a\u8d64\u677e\u7f8e\u7d00\uff65\uff65\uff65\uff12\uff12\u7b2c40\u56de\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u958b\u50ac\u5831\u544a\u52a0\u85e4\u535a\u660e\uff65\uff65\uff65\uff12\uff13\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u90e8\u4f1a\u5275\u8a2d10\u5468\u5e74\u529f\u52b4\u8005\u7279\u5225\u8868\u5f70\uff65\uff65\uff65\uff12\uff14\uff1c\u4f1a\u544a\uff1e\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u30d5\u30a9\u30fc\u30e9\u30e02013\u300c\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea\uff0d\u30ea\u30ac\u30f3\u30c9\u9593\u76f8\u4e92\u4f5c\u7528\u89e3\u6790\u3068\u69cb\u9020\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30de\u30c6\u30a3\u30af\u30b9\u300d\uff65\uff65\uff65\uff12\uff15\u7b2c41\u56de\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\uff65\uff65\uff65\uff12\uff16\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u90e8\u4f1a\u30fb\u30cb\u30e5\u30fc\u30b9\u30ec\u30bf\u30fc<1April,2013>SARNewsNo.24(Apr.2013)-2-\/\/\/\/\/Perspective\/Retrospective\/\/\/\/\/\u5275\u85ac\u652f\u63f4\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u3068\u30d0\u30a4\u30aa\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30de\u30c6\u30a3\u30af\u30b9\u306b\u3088\u308b\u30c7\u30fc\u30bf\u7d71\u5408\u533b\u85ac\u57fa\u76e4\u7814\u7a76\u6240\u30fb\u30d0\u30a4\u30aa\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30de\u30c6\u30a3\u30af\u30b9\u30d7\u30ed\u30b8\u30a7\u30af\u30c8\u30fb\u6c34\u53e3\u8ce2\u53f81.\u306f\u3058\u3081\u306b\u30d3\u30b8\u30cd\u30b9\u30a4\u30f3\u30c6\u30ea\u30b8\u30a7\u30f3\u30b9\u3084\u30d3\u30c3\u30b0\u30c7\u30fc\u30bf\u89e3\u6790\u3068\u3044\u3063\u305f\u30ad\u30fc\u30ef\u30fc\u30c9\u304c\u5404\u65b9\u9762\u3067\u6ce8\u76ee\u3055\u308c\u3066\u3044\u308b\u304c\u3001\u5275\u85ac\u7814\u7a76\u3042\u308b\u3044\u306f\u533b\u5b66\u751f\u547d\u79d1\u5b66\u5168\u822c\u306b\u304a\u3044\u3066\u3082\u3001\u96c6\u7a4d\u3055\u308c\u305f\u5927\u898f\u6a21\u306a\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u306e\u77e5\u8b58\u767a\u898b\u3084\u610f\u601d\u6c7a\u5b9a\u304c\u3001\u73fe\u5728\u306e\u91cd\u8981\u306a\u8ab2\u984c\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u306f\u9593\u9055\u3044\u306a\u3044\u3002\u7279\u306b\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u3001\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea\u304b\u3089\u75be\u60a3\u60c5\u5831\u306b\u3044\u305f\u308b\u307e\u3067\u5e45\u5e83\u3044\u60c5\u5831\u304c\u516c\u5171\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u4e0a\u306b\u84c4\u7a4d\u3055\u308c\u3066\u304d\u3066\u3044\u308b\u4e2d\u3001\u5f93\u6765\u306e\u3088\u3046\u306b\u65b0\u898f\u306e\u5b9f\u9a13\u3092\u884c\u306a\u3063\u3066\u77e5\u8b58\u3092\u767a\u898b\u3059\u308b\u306e\u306b\u52a0\u3048\u3066\uff08\u3042\u308b\u3044\u306f\u305d\u306e\u4ee3\u308f\u308a\u306b\uff09\u3001\u516c\u5171\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u307f\u304b\u3089\u77e5\u8b58\u3092\u5f15\u304d\u51fa\u305b\u308b\u304b\u3001\u3068\u3044\u3046\u306e\u304c\u6211\u3005\u30d0\u30a4\u30aa\u30a4\u30f3\u30d5\u30a9\u30de\u30c6\u30a3\u30af\u30b9\u5206\u91ce\u306e\u7814\u7a76\u8005\u306b\u8ab2\u305b\u3089\u308c\u305f\u91cd\u8981\u306a\u8ab2\u984c\u3060\u3068\u8003\u3048\u3066\u3044\u308b\u3002\u533b\u5b66\u751f\u547d\u79d1\u5b66\u5206\u91ce\u3067\u306f\u3001\u516c\u5171\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u306e\u6570\u3068\u6271\u3046\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u591a\u69d8\u6027\u304b\u3089\u3001\u3053\u306e\u4f5c\u696d\u306b\u306f\u73fe\u5728\u3082\u306a\u304a\u5927\u5909\u306a\u56f0\u96e3\u304c\u3064\u304d\u307e\u3068\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u672c\u7a3f\u3067\u306f\u3001\u5275\u85ac\u652f\u63f4\u306e\u57fa\u76e4\u7814\u7a76\u3092\u4f7f\u547d\u3068\u3059\u308b\u3001\u533b\u85ac\u57fa\u76e4\u7814\u7a76\u6240\uff08http:\/\/www.nibio.go.jp\/\uff09\u306e\u6211\u3005\u306e\u30b0\u30eb\u30fc\u30d7\u3067\u306e\u6d3b\u52d5\uff08http:\/\/www.mizuguchilab.org\/\uff09\u3092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4\u3002iiRMSD(S,Q)\u2265LB(2)\u5f0f(2)\u3088\u308a\u4efb\u610f\u306e\u95be\u5024c\u3088\u308a\u3082\u5927\u304d\u306aLBi\u3092\u6301\u3064\u90e8\u5206\u69cb\u9020Si\u306b\u95a2\u3057\u3066\u306f\u3001RMSD\u304c\u5fc5\u305ac\u3088\u308a\u3082\u5927\u304d\u3044\u3002\u3059\u306a\u308f\u3061\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u4e2d\u306e\u3059\u3079\u3066\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306b\u5bfe\u3057\u3066RMSD\u306e\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3046\u524d\u306b\u3001LBi>c\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020Si\u306fRMSD\u8a08\u7b97\u304b\u3089\u9664\u5916\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u3067\u304d\u308b\u3002KO14SARNewsNo.24(Apr.2013)-21-3.2SCOP\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u306b\u3088\u308b\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306e\u691c\u8a3c\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9SCOPrelease1.75(SCOP1.75)\u3092\u7528\u3044\u3066\u691c\u8a3c\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002SCOP1.75\u306b\u306f\u7d0411\u4e07\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u304c\u767b\u9332\u3055\u308c\u3066\u304a\u308a\u3001\u7d042000\u4e07\u306eC\u03b1\u5ea7\u6a19\u304c\u767b\u9332\u3055\u308c\u3066\u3044\u308b\u3002\u30e9\u30f3\u30c0\u30e0\u306b\u9078\u3093\u3060100\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u3092\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u3068\u3057\u3001RMSD\u306e\u95be\u5024\u30921.0\u00c5\u306b\u56fa\u5b9a\u3057\u3001\u554f\u5408\u305b\u5ea7\u6a19\u306e\u9577\u3055\u309210~200\u3067\u691c\u7d22\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002\u672c\u7814\u7a76\u3067\u958b\u767a\u3055\u308c\u305f\u624b\u6cd5\u3092LB3D\u3001\u6bd4\u8f03\u5bfe\u8c61\u3068\u3057\u3066\u3001SCOP1.75\u4e2d\u306e\u3059\u3079\u3066\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306b\u5bfe\u3057\u3066RMSD\u306e\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3046Na\u00efve\u3092\u8a2d\u5b9a\u3057\u305f\u3002\u7d50\u679c\u3092Figure1\u306b\u793a\u3059\u3002\u6a2a\u8ef8\u306b\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u3001\u7e26\u8ef8\u306b\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u4e2d\u306e100\u4e07\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306e\u691c\u7d22\u306b\u304b\u304b\u3063\u305f\u6642\u9593\u306e\u5e73\u5747\u5024\u3092\u5bfe\u6570\u76ee\u76db\u3067\u793a\u3057\u305f\u3002\u6ce8\u610f\u3059\u3079\u304d\u70b9\u3068\u3057\u3066\u3001LB3D,Na\u00efve\u3069\u3061\u3089\u3082RMSD\u304c1.0\u00c5\u4ee5\u4e0b\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u3092\u5168\u3066\u691c\u7d22\u3057\u3066\u304a\u308a\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306f\u9055\u3046\u304c\u691c\u7d22\u7d50\u679c\u306f\u540c\u3058\u3067\u3042\u308b\u3002Figure1.SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306e\u6bd4\u8f03SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u691c\u7d22\u306e\u7d50\u679c\u304b\u3089\u3001Na\u00efve\u306e\u8a08\u7b97\u901f\u5ea6\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u5897\u3048\u308b\u306b\u3057\u305f\u304c\u3063\u3066\u3001\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u304c\u4f4e\u4e0b\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002\u4e00\u65b9LB3D\u306f\u305d\u306e\u9006\u3067\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u5897\u52a0\u3059\u308b\u307b\u3069\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u304c\u901f\u304f\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u3053\u308c\u306f\u3001LB\u306b\u3088\u308b\u30d5\u30a3\u30eb\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u304c\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u591a\u3044\u307b\u3069\u52b9\u679c\u7684\u306b\u50cd\u3044\u3066\u3044\u308b\u3053\u3068\u3092\u793a\u3057\u3066\u3044\u308b\u30023.2\u691c\u7d22\u306e\u5b9f\u65bd\u4f8bHelix-turn-helix\u306e\u69cb\u9020\u30e2\u30c1\u30fc\u30d5\u3092\u6301\u3064Calcium-bindingprotein(PDBID:2lap)\u306e\u6b8b\u57fa\u756a\u53f7107-126\u306e\uff12\uff10\u6b8b\u57fa\u3092\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u3068\u3057\u3001SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u691c\u7d22\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002RMSD\u306e\u95be\u5024\u306f2.0\u00c5\u3068\u3057\u305f\u3002\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u306e\u8aad\u307f\u8fbc\u307f\u304b\u3089\u8a08\u7b97\u7d50\u679c\u306e\u51fa\u529b\u307e\u3067\u306e\u5b9f\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u306f7.6sec\u3001\u30d5\u30a1\u30a4\u30eb\u306e\u5165\u51fa\u529b\u6642\u9593\u3092\u9664\u304f\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u306f4.2sec\u3067\u3042\u3063\u305f\u3002RMSD\u22662.0\u00c5\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304c1009\u500b\u691c\u7d22\u3055\u308c\u305f\u3002\u691c\u7d22\u7d50\u679c\u306e\u4e00\u90e8\u3092Figure3\u306b\u793a\u3059\u3002\u691c\u7d22\u3055\u308c\u305fSCOPIDd2ggmb1\u3068d1g33a_\u306f\u985e\u4f3c\u3057\u305f\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304cCalciumbindingsite\u3067\u3042\u3063\u305f\u3002\u3053\u306e\u3088\u3046\u306b\u5168\u4f53\u306e\u69cb\u9020\u304c\u7570\u306a\u3063\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304c\u985e\u4f3c\u3057\u3066\u3044\u308b\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea\u3092\u9ad8\u901f\u306b\u691c\u7d22\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u53ef\u80fd\u3067\u3042\u308b\u3002\u307e\u305f\u30a2\u30df\u30ce\u9178\u914d\u5217\u691c\u7d22\u3067\u306f\u4f7f\u7528\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u96e3\u3057\u304420\u6b8b\u57fa\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u3067\u3082\u3001\u78ba\u5b9f\u306b\u985e\u4f3c\u69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90e8\u5206\u69cb\u9020\u306b\u5bfe\u3057\u3066RMSD\u306e\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3046\u524d\u306b\u3001LBi>c\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020Si\u306fRMSD\u8a08\u7b97\u304b\u3089\u9664\u5916\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u3067\u304d\u308b\u3002KO14SARNewsNo.24(Apr.2013)-21-3.2SCOP\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u306b\u3088\u308b\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306e\u691c\u8a3c\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9SCOPrelease1.75(SCOP1.75)\u3092\u7528\u3044\u3066\u691c\u8a3c\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002SCOP1.75\u306b\u306f\u7d0411\u4e07\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u304c\u767b\u9332\u3055\u308c\u3066\u304a\u308a\u3001\u7d042000\u4e07\u306eC\u03b1\u5ea7\u6a19\u304c\u767b\u9332\u3055\u308c\u3066\u3044\u308b\u3002\u30e9\u30f3\u30c0\u30e0\u306b\u9078\u3093\u3060100\u30c9\u30e1\u30a4\u30f3\u3092\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u3068\u3057\u3001RMSD\u306e\u95be\u5024\u30921.0\u00c5\u306b\u56fa\u5b9a\u3057\u3001\u554f\u5408\u305b\u5ea7\u6a19\u306e\u9577\u3055\u309210~200\u3067\u691c\u7d22\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002\u672c\u7814\u7a76\u3067\u958b\u767a\u3055\u308c\u305f\u624b\u6cd5\u3092LB3D\u3001\u6bd4\u8f03\u5bfe\u8c61\u3068\u3057\u3066\u3001SCOP1.75\u4e2d\u306e\u3059\u3079\u3066\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306b\u5bfe\u3057\u3066RMSD\u306e\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3046Na\u00efve\u3092\u8a2d\u5b9a\u3057\u305f\u3002\u7d50\u679c\u3092Figure1\u306b\u793a\u3059\u3002\u6a2a\u8ef8\u306b\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u3001\u7e26\u8ef8\u306b\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u4e2d\u306e100\u4e07\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306e\u691c\u7d22\u306b\u304b\u304b\u3063\u305f\u6642\u9593\u306e\u5e73\u5747\u5024\u3092\u5bfe\u6570\u76ee\u76db\u3067\u793a\u3057\u305f\u3002\u6ce8\u610f\u3059\u3079\u304d\u70b9\u3068\u3057\u3066\u3001LB3D,Na\u00efve\u3069\u3061\u3089\u3082RMSD\u304c1.0\u00c5\u4ee5\u4e0b\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u3092\u5168\u3066\u691c\u7d22\u3057\u3066\u304a\u308a\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306f\u9055\u3046\u304c\u691c\u7d22\u7d50\u679c\u306f\u540c\u3058\u3067\u3042\u308b\u3002Figure1.SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u306e\u6bd4\u8f03SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u691c\u7d22\u306e\u7d50\u679c\u304b\u3089\u3001Na\u00efve\u306e\u8a08\u7b97\u901f\u5ea6\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u5897\u3048\u308b\u306b\u3057\u305f\u304c\u3063\u3066\u3001\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u304c\u4f4e\u4e0b\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002\u4e00\u65b9LB3D\u306f\u305d\u306e\u9006\u3067\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u5897\u52a0\u3059\u308b\u307b\u3069\u691c\u7d22\u901f\u5ea6\u304c\u901f\u304f\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u3053\u308c\u306f\u3001LB\u306b\u3088\u308b\u30d5\u30a3\u30eb\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u304c\u3001\u554f\u5408\u305b\u69cb\u9020\u306e\u5ea7\u6a19\u6570\u304c\u591a\u3044\u307b\u3069\u52b9\u679c\u7684\u306b\u50cd\u3044\u3066\u3044\u308b\u3053\u3068\u3092\u793a\u3057\u3066\u3044\u308b\u30023.2\u691c\u7d22\u306e\u5b9f\u65bd\u4f8bHelix-turn-helix\u306e\u69cb\u9020\u30e2\u30c1\u30fc\u30d5\u3092\u6301\u3064Calcium-bindingprotein(PDBID:2lap)\u306e\u6b8b\u57fa\u756a\u53f7107-126\u306e\uff12\uff10\u6b8b\u57fa\u3092\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u3068\u3057\u3001SCOP1.75\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u691c\u7d22\u3092\u884c\u3063\u305f\u3002RMSD\u306e\u95be\u5024\u306f2.0\u00c5\u3068\u3057\u305f\u3002\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u306e\u8aad\u307f\u8fbc\u307f\u304b\u3089\u8a08\u7b97\u7d50\u679c\u306e\u51fa\u529b\u307e\u3067\u306e\u5b9f\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u306f7.6sec\u3001\u30d5\u30a1\u30a4\u30eb\u306e\u5165\u51fa\u529b\u6642\u9593\u3092\u9664\u304f\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u306f4.2sec\u3067\u3042\u3063\u305f\u3002RMSD\u22662.0\u00c5\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304c1009\u500b\u691c\u7d22\u3055\u308c\u305f\u3002\u691c\u7d22\u7d50\u679c\u306e\u4e00\u90e8\u3092Figure3\u306b\u793a\u3059\u3002\u691c\u7d22\u3055\u308c\u305fSCOPIDd2ggmb1\u3068d1g33a_\u306f\u985e\u4f3c\u3057\u305f\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304cCalciumbindingsite\u3067\u3042\u3063\u305f\u3002\u3053\u306e\u3088\u3046\u306b\u5168\u4f53\u306e\u69cb\u9020\u304c\u7570\u306a\u3063\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u304c\u985e\u4f3c\u3057\u3066\u3044\u308b\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea\u3092\u9ad8\u901f\u306b\u691c\u7d22\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u53ef\u80fd\u3067\u3042\u308b\u3002\u307e\u305f\u30a2\u30df\u30ce\u9178\u914d\u5217\u691c\u7d22\u3067\u306f\u4f7f\u7528\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u96e3\u3057\u304420\u6b8b\u57fa\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u3067\u3082\u3001\u78ba\u5b9f\u306b\u985e\u4f3c\u69cb\u9020\u3092\u691c\u7d22\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u53ef\u80fd\u3067\u3042\u308b\u3002Figure3.2lap(Black)\u3092\u554f\u3044\u5408\u308f\u305b\u69cb\u9020\u306b\u3057\u305f\u691c\u7d22\u7d50\u679c\uff08\u4e0a\uff1a\u5168\u4f53\u56f3\u3002\u4e0b\uff1a\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306e\u62e1\u5927\u56f3\uff09SCOPID:d2ggmb1RMSD=0.66,WhiteSCOPID:d1g33a_RMSD=1.00,GraySCOPID:d1xxhg2RMSD=2.00,Darkgray\uff14\uff0e\u7d50\u8ad6\u672c\u7814\u7a76\u3067\u958b\u767a\u3055\u308c\u305f\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u691c\u7d22\u6cd5\u306f\u3001RMSD\u306e\u4e0b\u9650\u5024\u3092\u4f7f\u7528\u3057\u5ea7\u6a19\u3092\u554f\u5408\u305b\u3068\u3059\u308b\u9ad8\u901f\u691c\u7d22\u6cd5\u3067\u3042\u308b\u3002\u30c7\u30fc\u30bf\u30d9\u30fc\u30b9\u4e2d\u306e\u3059\u3079\u3066\u306e\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u306b\u5bfe\u3057\u3066RMSD\u3092\u8a08\u7b97\u3059\u308b\u624b\u6cd5(Na\u00efve)\u3068\u6bd4\u8f03\u3057\u30662.3~1536\u500d\u9ad8\u901f\u306b\u691c\u7d22\u53ef\u80fd\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u304c\u793a\u3055\u308c\u305f\u4eca\u5f8cPDB\u306b\u767b\u9332\u3055\u308c\u308b\u60c5\u5831\u304c\u5897\u5927\u3059\u308b\u306b\u5f93\u3044\u3001\u672c\u7814\u7a76\u306e\u9ad8\u901f\u90e8\u5206\u69cb\u9020\u691c\u7d22\u6cd5\u304c\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea\u69cb\u9020\u89e3\u6790\u306b\u6709\u7528\u306a\u624b\u6cd5\u3068\u306a\u308b\u3068\u671f\u5f85\u3055\u308c\u308b\u3002\u6587\u732e[1]Terashi,G.,Shibuya,T.&#038;Takeda-Shitaka,M.LB3D:AProteinThree-DimensionalSubstructureSearchProgramBasedontheLowerBoundofaRootMeanSquareDeviationValue.JComputBiol19,493-503(2012).SARNewsNo.24(Apr.2013)-22-\/\/\/\/\/Activities\/\/\/\/\/\u7b2c9\u56de\u85ac\u7269\u306e\u5206\u5b50\u8a2d\u8a08\u3068\u958b\u767a\u306b\u95a2\u3059\u308b\u65e5\u4e2d\u5408\u540c\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u958b\u50ac\u5831\u544a\u7b2c9\u56de\u85ac\u7269\u306e\u5206\u5b50\u8a2d\u8a08\u3068\u958b\u767a\u306b\u95a2\u3059\u308b\u65e5\u4e2d\u5408\u540c\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u5b9f\u884c\u59d4\u54e1\u9577\u8d64\u677e\u7f8e\u7d00\u7b2c9\u56de\u85ac\u7269\u306e\u5206\u5b50\u8a2d\u8a08\u3068\u958b\u767a\u306b\u95a2\u3059\u308b\u65e5\u4e2d\u5408\u540c\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u304c2012\u5e749\u670821-24\u65e5\u3001\u4e2d\u83ef\u4eba\u6c11\u5171\u548c\u56fd\u3001\u6842\u6797\u5e02\u3067\u958b\u50ac\u3055\u308c\u307e\u3057\u305f\u3002\u4e2d\u56fd\u533b\u5b66\u79d1\u5b66\u9662\u85ac\u7269\u7814\u7a76\u6240\u30fb\u5f90\u67cf\u73b2\u6559\u6388\uff08\u4e2d\u56fd\u5074\uff09\u304a\u3088\u3073\u79c1\uff08\u65e5\u672c\u5074\uff09\u304c\u5b9f\u884c\u59d4\u54e1\u9577\u3092\u52d9\u3081\u3055\u305b\u3066\u3044\u305f\u3060\u304d\u307e\u3057\u305f\u3002\u6b8b\u5ff5\u306a\u3053\u3068\u306b\u3001\u958b\u50ac\u306e\u6570\u65e5\u524d\u306b\u9818\u571f\u3092\u5de1\u308b\u554f\u984c\u3067\u4e2d\u56fd\u5404\u5730\u306b\u304a\u3044\u3066\u53cd\u65e5\u30c7\u30e2\u304c\u8d77\u3053\u308a\u3001\u5f53\u521d\u65e5\u672c\u5074\u304b\u3089\u306f\u5b66\u751f6\u540d\u3092\u542b\u308023\u540d\u304c\u53c2\u52a0\u4e88\u5b9a\u3067\u3057\u305f\u304c\u3001\u53c2\u52a0\u8005\u306e\u6240\u5c5e\u4f1a\u793e\u3001\u5927\u5b66\u306a\u3069\u3067\u4e2d\u56fd\u6e21\u822a\u3092\u81ea\u7c9b\u3059\u308b\u3088\u3046\u6ce8\u610f\u559a\u8d77\u304c\u884c\u308f\u308c\u305f\u7d50\u679c\u30017\u540d\u304c\u53c2\u52a0\u3092\u53d6\u308a\u3084\u3081\u308b\u4e8b\u614b\u3068\u306a\u308a\u307e\u3057\u305f\uff08\u5b9f\u969b\u306e\u53c2\u52a0\u8005\u306f\u5b66\u751f3\u540d\u3092\u542b\u308016\u540d\uff09\u3002\u3057\u304b\u3057\u3001\u4e2d\u56fd\u306e\u5148\u751f\u65b9\u306e\u5fa1\u914d\u616e\u3067\u3001\u4f55\u306e\u554f\u984c\u3082\u306a\u304f\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u306f\u6210\u529f\u88e1\u306b\u7d42\u4e86\u3057\u307e\u3057\u305f\u3002\u5b9f\u884c\u59d4\u54e1\u9577\u306e\u5f90\u67cf\u73b2\u6559\u6388\u306f\u3082\u3068\u3088\u308a\u3001\u30b7\u30f3\u30dd\u30b8\u30a6\u30e0\u306e\u6e96\u5099\u3001\u904b\u55b6\u306b\u643a\u308f\u3063\u3066\u304f\u3060\u3055\u3063\u305f\u4e2d\u56fd\u306e\u5148\u751f\u65b9\u306f\u5927\u5909\u306b\u5fa1\u5fc3\u914d\u306b\u306a\u308a\u3001\u5fa1\u82e6\u52b4\u3055\u308c\u305f\u3053\u3068\u3068\u601d\u3044\u307e\u3059\u3002\u304a\u4e16\u8a71\u306b\u306a\u308a\u307e\u3057\u305f\u3053\u3068\u306b\u5fc3\u3088\u308a\u5fa1\u793c\u3092\u7533\u3057\u4e0a\u3052\u307e\u3059\u3002\u307e\u305f\u3001\u958b\u50ac\u306b\u5f53\u305f\u308a\u3001\u8cc7\u91d1\u306e\u5fa1\u63f4\u52a9\u3092\u3044\u305f\u3060\u304d\u307e\u3057\u305f\u65e5\u672c\u85ac\u5b66\u4f1a\u304a\u3088\u3073AFMC\uff08\u30a2\u30b8\u30a2\u533b\u85ac\u5316\u5b66\u9023\u5408\uff09\u3001\u306a\u3089\u3073\u306b\u53c2\u52a0\u8005\u306e\u7686\u69d8\u306b\u611f\u8b1d\u3044\u305f\u3057\u307e\u3059\u3002\u7dcf\u53c2\u52a0\u8005\u657072\u540d\u3001\u62db\u5f85\u8b1b\u6f141\u4ef6\u3001\u82e5\u624b\u306e\u80b2\u6210\u3082\u56f3\u308b\u3068\u3044\u3046\u958b\u50ac\u8da3\u65e8\u306b\u57fa\u3065\u304d\u3001\u5b66\u751f2\u540d\u306e\u53e3\u982d\u767a\u8868\u3092\u542b\u308016\u4ef6\u306e\u53e3\u982d\u767a\u8868\u300121\u4ef6\u306e\u30dd\u30b9\u30bf\u30fc\u767a\u8868\u304c\u884c\u308f\u308c\u3001\u6d3b\u767a\u306a\u8b70\u8ad6\u304c\u4ea4\u308f\u3055\u308c\u307e\u3057\u305f\u3002\u4eca\u5e74\u306f\u69cb\u9020\u6d3b\u6027\u76f8\u95a2\u624b\u6cd5\u306e\u5275\u59cb\u8005\u3067\u3042\u308bCorwinHansch\u535a\u58eb\uff08\u30a2\u30e1\u30ea\u30ab\u5408\u8846\u56fd\u30dd\u30e2\u30ca\u5927\u5b66\u540d\u8a89\u6559\u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